Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH2D7A6NKC9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms