Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LIPT2A6NK58 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LIPT2A6NK58 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms