Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms