Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TM2D2-203ENST00000456845 3295 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 FO393401.2-201ENST00000422009 1307 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CCL13-201ENST00000225844 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RNU1-47P-201ENST00000362966 163 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RNA5SP463-201ENST00000363030 120 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RNU4-59P-201ENST00000364447 116 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 IMPG1-203ENST00000369963 868 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 REG3G-203ENST00000409471 575 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 STSP1-201ENST00000412493 1151 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 YBX1P8-201ENST00000421881 943 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SNHG17-204ENST00000423536 517 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SOX9-AS1-203ENST00000424417 576 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC00444-201ENST00000435617 215 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL023584.1-201ENST00000437067 349 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AP1B1P1-202ENST00000448124 191 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RN7SL233P-201ENST00000469988 277 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RN7SL335P-201ENST00000482790 304 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL031864.2-201ENST00000498507 350 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC01606-205ENST00000519314 562 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AP000880.1-202ENST00000526487 588 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TMEM132D-AS1-204ENST00000537367 531 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC078905.1-201ENST00000560803 509 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC009063.2-201ENST00000563981 906 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC004224.2-201ENST00000574423 529 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RN7SL237P-201ENST00000580912 287 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 FAM205C-203ENST00000603640 1017 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL022324.3-201ENST00000609330 747 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL451054.3-201ENST00000611115 776 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MIR6745-201ENST00000612694 127 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CU638689.2-201ENST00000623809 818 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC02086-204ENST00000628006 786 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL138924.1-201ENST00000629067 415 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC233280.20-201ENST00000637412 416 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms