Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 MTND1P10-201ENST00000426108 832 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026774.2-201ENST00000513990 1098 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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TRAPPC6BQ86SZ2 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC012065.3-201ENST00000602736 439 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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TRAPPC6BQ86SZ2 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AC017037.4-201ENST00000624526 826 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC6BQ86SZ2 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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