Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 LMO3-204ENST00000354662 3574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
CTXN3Q4LDR2 AC124045.1-201ENST00000606008 1953 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CTXN3Q4LDR2 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CTXN3Q4LDR2 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CTXN3Q4LDR2 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CTXN3Q4LDR2 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CTXN3Q4LDR2 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CTXN3Q4LDR2 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CTXN3Q4LDR2 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CTXN3Q4LDR2 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CTXN3Q4LDR2 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CTXN3Q4LDR2 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CTXN3Q4LDR2 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms