Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL353753.1-201ENST00000612217 2320 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CDH18Q13634 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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