Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 C12orf66-202ENST00000398055 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 PHC1-214ENST00000544916 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 TNPO3-205ENST00000627585 4514 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 TAAR8-201ENST00000275200 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 CHCHD2P5-201ENST00000421414 400 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 AP004833.3-201ENST00000531893 322 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 RPS28P1-201ENST00000604589 187 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 SMC3-201ENST00000361804 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 PGM2-201ENST00000381967 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 CHD3-202ENST00000358181 7286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 ATP1A3-207ENST00000543770 3427 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 KLHL8-202ENST00000425278 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 NCOA6-201ENST00000359003 7081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 FAM239B-202ENST00000424415 2194 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 PIGA-201ENST00000333590 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 LINC01854-201ENST00000375987 2213 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 CASK-208ENST00000442742 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 AP004782.1-201ENST00000623990 3433 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 TMEM213-203ENST00000442682 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 PHF6-204ENST00000370803 4489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TRHP20396 DDX3Y-202ENST00000360160 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TRHP20396 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TRHP20396 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
TRHP20396 NFASC-223ENST00000513543 3974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 TBCA-201ENST00000306388 2301 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 ZNF189-204ENST00000615466 2316 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 TIGIT-206ENST00000486257 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 RAB18-201ENST00000356940 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 OR7A17-201ENST00000327462 1127 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 RN7SKP239-201ENST00000364814 295 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 SNORA35.1-201ENST00000458908 128 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC078962.2-201ENST00000541885 712 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 RRP12-201ENST00000315563 4038 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 CLIP1-201ENST00000302528 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 TRIM16-201ENST00000336708 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 AC023509.2-201ENST00000548347 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 FBXO38-202ENST00000340253 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 LINC01725-205ENST00000457273 1991 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 MTO1-205ENST00000415954 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 FCRLA-209ENST00000367957 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 CR2-201ENST00000367057 4240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TRHP20396 TROVE2-204ENST00000367445 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRHP20396 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRHP20396 STK36-202ENST00000392105 4821 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRHP20396 LY9-201ENST00000263285 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRHP20396 SEC14L1-201ENST00000392476 2957 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRHP20396 ZNF135-203ENST00000401053 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRHP20396 LINC00402-201ENST00000419499 3340 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRHP20396 ADAM1A-201ENST00000424240 2129 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms