Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 LDHC-204ENST00000536880 957 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 Z99289.1-201ENST00000585373 807 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 VN1R66P-201ENST00000412929 916 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AGKP1-201ENST00000455254 1263 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SGCZQ96LD1 AC105430.1-202ENST00000567477 483 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms