Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 ZNF207-207ENST00000577908 4672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC015923.1-202ENST00000581421 491 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 RNF145-209ENST00000520638 2340 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 IL31RA-203ENST00000359040 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 RRP8-201ENST00000254605 6560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.8 ms