Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CASP1P29466 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CASP1P29466 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CASP1P29466 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CASP1P29466 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CASP1P29466 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CASP1P29466 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CASP1P29466 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CASP1P29466 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CASP1P29466 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CASP1P29466 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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CASP1P29466 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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CASP1P29466 HSPD1P4-201ENST00000547203 1702 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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CASP1P29466 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CASP1P29466 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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CASP1P29466 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CASP1P29466 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CASP1P29466 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CASP1P29466 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CASP1P29466 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CASP1P29466 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CASP1P29466 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CASP1P29466 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CASP1P29466 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CASP1P29466 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CASP1P29466 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CASP1P29466 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CASP1P29466 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CASP1P29466 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CASP1P29466 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CASP1P29466 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CASP1P29466 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CASP1P29466 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CASP1P29466 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CASP1P29466 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CASP1P29466 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CASP1P29466 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CASP1P29466 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CASP1P29466 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CASP1P29466 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CASP1P29466 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CASP1P29466 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CASP1P29466 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CASP1P29466 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CASP1P29466 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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