Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SSR1-206ENST00000479365 1118 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC015923.1-202ENST00000581421 491 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AMYH02020865.1-207ENST00000617096 458 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PPARGC1AQ9UBK2 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01687-203ENST00000420255 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 DLG5-AS1-201ENST00000449852 487 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PPARGC1AQ9UBK2 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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