Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CEP44Q9C0F1 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CEP44Q9C0F1 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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