Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 C11orf88-203ENST00000529167 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC133485.2-201ENST00000566232 2484 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
COG3Q96JB2 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms