Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 DSC3-202ENST00000434452 6978 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 STAB2-201ENST00000388887 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 MEP1B-201ENST00000269202 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 ONECUT2-202ENST00000491143 16121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 VN2R1P-201ENST00000449668 1743 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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