Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 ZNF300-203ENST00000418587 3226 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SVOP-205ENST00000610966 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 TTPAL-202ENST00000372904 6234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 TNPO1-213ENST00000523768 2632 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 ICE2-213ENST00000561114 3796 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 COPS4-206ENST00000509093 2273 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 KLK2-203ENST00000391810 2674 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 GIMAP6-203ENST00000618759 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RPA4-201ENST00000373040 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 LINC01837-205ENST00000635947 1557 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 DNTT-202ENST00000630152 1954 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 LRRN2-202ENST00000367176 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 TRPV1-202ENST00000399756 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 ZNF572-201ENST00000319286 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 NFKB1-205ENST00000505458 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 OGDH-205ENST00000444676 3309 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 OR11L1-201ENST00000355784 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 TMEM14EP-201ENST00000408960 378 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC006450.2-201ENST00000429482 581 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC098828.3-201ENST00000430429 746 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AL158819.1-202ENST00000440645 447 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AL137074.1-201ENST00000442640 465 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC245102.1-201ENST00000454989 520 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC127070.1-201ENST00000488441 484 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RN7SL597P-201ENST00000491551 296 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC008592.1-201ENST00000503091 665 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC024581.1-201ENST00000514791 566 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 LYPLA1-213ENST00000522007 250 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC104316.2-201ENST00000559049 326 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 ALOX12-AS1-207ENST00000574377 886 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 MIR3689D2-201ENST00000580187 80 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 MIR4442-201ENST00000583412 67 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 MXRA7-205ENST00000588114 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 KHDC1-206ENST00000610330 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AP003500.1-201ENST00000626400 527 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AL021368.4-201ENST00000637710 675 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 MIR193BHG-210ENST00000641327 515 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SEC23B-202ENST00000336714 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 GLYAT-202ENST00000344743 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 GDPD2-201ENST00000374382 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SLC44A4-210ENST00000544672 2634 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC007614.6-201ENST00000623729 2620 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 EXOC2-201ENST00000230449 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 ACRV1-204ENST00000533904 2212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 FOXJ2-202ENST00000428177 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 KCNB2-201ENST00000523207 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 NRP1-207ENST00000374875 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SLC6A12-201ENST00000359674 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 PCYT1A-201ENST00000292823 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC018512.1-201ENST00000417761 2326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 PIK3R5-209ENST00000581552 3253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 JAM2-201ENST00000312957 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 NUGGC-201ENST00000413272 3887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SMIM8-204ENST00000392863 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RAD17-204ENST00000354312 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 AC138869.3-201ENST00000563960 2486 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 LINC00664-202ENST00000596718 3029 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 PPP1R3C-201ENST00000238994 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 VIT-201ENST00000379241 2525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 CCDC13-AS1-201ENST00000418161 2049 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 HAUS6P1-201ENST00000421150 1551 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 TDRD1-203ENST00000369282 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 MMS19-209ENST00000438925 3797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 LILRB4-203ENST00000391734 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 RAD9B-205ENST00000409425 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 KIF9-201ENST00000265529 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 ZNF304-204ENST00000598744 3331 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 CDH1-214ENST00000621016 3304 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATXN8OSP0DMR3 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms