Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 SVIL-202ENST00000375398 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 IL31RA-203ENST00000359040 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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VPS8Q8N3P4 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPS8Q8N3P4 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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