Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 ATP8B1-201ENST00000283684 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC135012.3-201ENST00000599841 4039 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 SLC7A2-202ENST00000398090 7557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AL355306.2-203ENST00000635102 1025 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
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PTCH1Q13635 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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PTCH1Q13635 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
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PTCH1Q13635 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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PTCH1Q13635 ONECUT2-202ENST00000491143 16121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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PTCH1Q13635 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 SCUBE3-201ENST00000274938 7356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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PTCH1Q13635 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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PTCH1Q13635 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
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PTCH1Q13635 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
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PTCH1Q13635 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
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