Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC073065.1-201ENST00000411678 2866 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AL590004.4-201ENST00000566733 7060 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 ILDR2-201ENST00000271417 13140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 OR4C1P-202ENST00000641065 1569 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 CSMD1-206ENST00000520002 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 CSMD1-216ENST00000602557 11740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 C2orf76-203ENST00000409523 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PTCH1Q13635 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
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PTCH1Q13635 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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PTCH1Q13635 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
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PTCH1Q13635 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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PTCH1Q13635 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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PTCH1Q13635 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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PTCH1Q13635 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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PTCH1Q13635 C14orf37-201ENST00000267485 6495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
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PTCH1Q13635 LCA5-201ENST00000369846 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 WNT2B-203ENST00000369686 10879 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 EZH1-201ENST00000415827 4608 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
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PTCH1Q13635 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PTCH1Q13635 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
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