Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 RBMY1A3P-201ENST00000382670 1404 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
AP3M2P53677 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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