Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 PPFIA2-202ENST00000407050 3903 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC121758.1-201ENST00000557452 3942 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 CHL1-AS1-201ENST00000417612 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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HOXD12P35452 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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HOXD12P35452 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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HOXD12P35452 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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HOXD12P35452 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD12P35452 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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HOXD12P35452 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
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HOXD12P35452 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD12P35452 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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