Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF6Q9Y4K3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF6Q9Y4K3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF6Q9Y4K3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF6Q9Y4K3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF6Q9Y4K3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF6Q9Y4K3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF6Q9Y4K3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF6Q9Y4K3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms