Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIF3AQ9Y496 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF3AQ9Y496 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms