Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LEMD3Q9Y2U8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LEMD3Q9Y2U8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms