Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM2AQ9Y2K7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM2AQ9Y2K7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms