Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF13BQ9Y275 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF13BQ9Y275 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms