Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIGD1AQ9Y241 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIGD1AQ9Y241 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms