Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms