Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THSD7AQ9UPZ6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
THSD7AQ9UPZ6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
THSD7AQ9UPZ6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
THSD7AQ9UPZ6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
THSD7AQ9UPZ6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms