Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SETD1BQ9UPS6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1BQ9UPS6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1BQ9UPS6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1BQ9UPS6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1BQ9UPS6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1BQ9UPS6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1BQ9UPS6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1BQ9UPS6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1BQ9UPS6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1BQ9UPS6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1BQ9UPS6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SETD1BQ9UPS6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SETD1BQ9UPS6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SETD1BQ9UPS6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms