Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP18Q9UMW8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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USP18Q9UMW8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP18Q9UMW8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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