Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHTF1Q9UMS5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHTF1Q9UMS5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms