Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJD2Q9UKL4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJD2Q9UKL4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms