Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRTO4Q9UKD2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRTO4Q9UKD2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms