Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DKK3Q9UBP4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DKK3Q9UBP4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms