Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CC2D2AQ9P2K1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CC2D2AQ9P2K1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms