Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHPF2Q9P2E5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHPF2Q9P2E5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms