Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC88CQ9P219 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms