Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CALCOCO1Q9P1Z2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms