Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHMP5Q9NZZ3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP5Q9NZZ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms