Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
TMOD3Q9NYL9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
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TMOD3Q9NYL9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMOD3Q9NYL9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
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