Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VNN3Q9NY84 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VNN3Q9NY84 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms