Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHBDL2Q9NX52 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDL2Q9NX52 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms