Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms