Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DCAF13Q9NV06 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DCAF13Q9NV06 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms