Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPTLC3Q9NUV7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms