Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC86Q9H6F5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms