Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF1DQ9H5J8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAF1DQ9H5J8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms