Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ASXL3Q9C0F0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ASXL3Q9C0F0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms