Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIPCQ9C0C6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms